Исследование динамики белков методом спинового зха ЯМР

Раздел: О воде
03-11-2018

Использование импульсных методов ЯМР, в первую очередь метода спинового эха, позволило реализовать другие подходы к изучению конформационной подвижности в белках и ее связи с биологической функцией различных биополимеров. С помощью этих методов были выполнены исследования суммарных кривых восстановления продольной намагниченности, в том числе во вращающейся системе координат, для протонов различных белков. Целью работы было выявление общего вклада внутреннего движения в процессы спин-решеточной релаксации и выделение отдельных видов такого движения, если их частоты, при изменении условий эксперимента, совпадут с частотой резонанса.

Данные кривые для протонов белков в D2O или для кристаллов или порошков белков довольно хорошо описывались единой экспонентой (исключая белки, содержащие парамагнитные атомы). Это связано с влиянием процессов спиновой диффузии между большинством протонов белка, а в порошках и кристаллах — также воздействием протонов кристаллизационной и гидратной воды, что подтверждается и другими авторами. Поэтому для устранения влияния протонов воды на релаксацию протонов белков порошки белков получали лиофилизацией из растворов белков в тяжелой воде. Наличие единой экспоненты позволило приписать каждой кривой единое значение Тг практически для всех протонов определенного белка.

Измеренные значения Тг для протонов белков в воде зависят как от вращательного диффузионного движения самих белковых глобул, так и от наличия внутреннего движения в пределах макромолекул. Замедление движения глобул в воде при повышении массы белка или вязкости растворов или при переходе к высоким концентрациям белка приводит к некоторой постоянной величине Тг для протонов белков, определяемой лишь внутренним движением. Для выделения вклада различных видов внутреннего движения были изучены температурная и частотная зависимости Тг для протонов некоторых белков.


Другие статьи по теме:
 Сорбция-десорбция белков как фактор регуляции активности в клетке
 Об эффектах «динамики живой протоплазмы»
 Результаты, полученные с помощью импульсных методов ЯМР
 Процессы регуляции и надежность биологических систем
 Влияние воды на структуру, динамику и функцию фотосинтетических мембран

Добавить комментарий:
Введите ваше имя:

Комментарий:

Защита от спама - решите пример:

У вас вопрос или предложение? ПИШИТЕ НАМ!