Динамическая структура глобулярных белков и ее связь с функциональными характеристиками белков

Раздел: О воде
11-09-2018

Данные по пространственной структуре белков в кристаллическом состоянии позволяют получить лишь общее представление об их реальной структуре в водной среде и о связи особенностей этой структуры с механизмами функционирования белковых макромолекул. Здесь имеется в виду, прежде всего, появление в воде динамической структуры глобулярных белков, которая отражает наличие равновесия сил в пределах белковых макромолекул, необходимое для управления биологическими процессами и для их избирательности. С нею ряд авторов связывает также высокую эффективность биологических реакций, в первую очередь реакций ферментативного катализа.

Предполагается, что многие особенности процессов функционирования белковых макромолекул в водной среде могут быть объяснены на основе существования у них большого числа быстро меняющихся конформаций из-за конформационной подвижности белков в воде. Впервые представления о конформационной подвижности были введены для объяснения способности транспортных белков связывать и переносить разнообразные вещества. С внутренней динамикой белков, как отмечалось, связывают также механизм действия протеолитических ферментов. Но особое внимание динамическая структура белков привлекает в связи с попытками объяснения на ее основе высокой эффективности ферментативного катализа. Согласно оценкам, приводимым Волькенштейном для двух гипотетических реакций с двумя субстратами, разрыв между реальной и рассчитываемой на основе известных ранее физико-химических факторов скоростью катализа достигает 9-12 порядков. Поэтому такой интерес вызывают поиски возможных физических механизмов, которые могли бы устранить подобный разрыв.

12

Другие статьи по теме:
 Состояние воды и биологическая активность
 Проблема связи между структурой и функцией белков
 Вода, у тебя нет ни вкуса, ни цвета, ни запаха
 Роль динамики белков в регуляции процессов на клеточном уровне
 Влияние воды на динамические и некоторые функциональные характеристики биологических мембран

Добавить комментарий:
Введите ваше имя:

Комментарий:

Защита от спама - решите пример:

У вас вопрос или предложение? ПИШИТЕ НАМ!